Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gbp4Q61107 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gbp4Q61107 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gbp4Q61107 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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