Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp17laQ61068 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms