Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd6Q61003 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms