Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms