Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms