Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms