Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Xrcc1Q60596 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Xrcc1Q60596 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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Xrcc1Q60596 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Xrcc1Q60596 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Xrcc1Q60596 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc1Q60596 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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