Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myh1Q5SX40 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms