Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms