Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam71bQ5STT6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms