Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms