Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms