Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms