Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ecm2Q5FW85 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms