Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms