Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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