Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms