Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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Znf608Q56A10 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms