Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc1cQ4KL78 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms