Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms