Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm5935Q497S0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm5935Q497S0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm5935Q497S0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Gm5935Q497S0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5935Q497S0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Gm5935Q497S0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm5935Q497S0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5935Q497S0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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