Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms