Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Defa20Q45VN2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Defa20Q45VN2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Defa20Q45VN2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Defa20Q45VN2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Defa20Q45VN2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Defa20Q45VN2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Defa20Q45VN2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa20Q45VN2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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