Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Afg1lQ3V384 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Afg1lQ3V384 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Afg1lQ3V384 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afg1lQ3V384 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms