Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms