Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ccdc185Q3V118 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc185Q3V118 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc185Q3V118 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc185Q3V118 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Ccdc185Q3V118 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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