Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah12Q3V0Q1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah12Q3V0Q1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms