Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc43Q3V0L5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Lrrc43Q3V0L5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Lrrc43Q3V0L5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
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Lrrc43Q3V0L5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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