Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933416C03RikQ3V063 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms