Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcho2Q3UQN2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms