Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms