Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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