Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms