Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Usp19Q3UJD6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Usp19Q3UJD6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Usp19Q3UJD6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp19Q3UJD6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Usp19Q3UJD6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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Usp19Q3UJD6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Usp19Q3UJD6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Usp19Q3UJD6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Usp19Q3UJD6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Usp19Q3UJD6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Usp19Q3UJD6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Usp19Q3UJD6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Usp19Q3UJD6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Usp19Q3UJD6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Usp19Q3UJD6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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