Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm648Q3UJ22 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm648Q3UJ22 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm648Q3UJ22 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm648Q3UJ22 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm648Q3UJ22 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms