Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LchnQ3UHG7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LchnQ3UHG7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms