Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms