Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd8Q3UFK8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms