Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr41Q3UDP0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms