Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms