Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms