Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms