Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U595 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3U595 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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