Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud5Q3U2S4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms