Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TraddQ3U0V2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms