Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms