Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms