Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxw18Q3TSA9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms