Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms