Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms